Naruto çoxdan qabiliyyətlərini bilməyən narahat gənc deyil, amma onu müdrik bir ninja təcrübəsi adlandırmaq hələ çətindir. Buna baxmayaraq, onun bir komandası var və onlar böyük bir şinobi lideri olmaq hüququ üçün qaranlıq qüvvələrlə mübarizə aparmağa hazırdırlar. Oyun Ninja Runner Runato mərhələsində, qəhrəmanın axını qurumayan növbəti düşmənlərini məğlub etməyə kömək edə bilərsiniz. Rəqiblərin sayı böyükdür və qəhrəman sürətlə yola düşür. O, sürətlə qaçacaq və qarşıdakı maneələrə həm canlı, həm də cansız cavab verməyə məcbur edəcəksiniz.