Pandemic 2 oyununun ikinci hissəsində siz ölümcül pandemiya kimi bütün bəşəriyyəti məhv etmək missiyanıza davam edəcəksiniz. Oyun xəstəliyin növünü seçməklə başlayır: virus, bakteriya və ya parazit. Bundan sonra infeksiyanız üçün başlanğıc nöqtəsini seçəcəksiniz. Oradan xəstəliyini bütün dünyaya yaymalı olacaqsan. Bütün dünyaya yayılmaqla, siz xəstəliyinizi yaxşılaşdıra və insanların bundan əziyyət çəkməməsi üçün edə bilərsiniz. Virusunuzu daim dəyişdirin ki, bəşəriyyət onun müalicəsini tapa bilməsin. Beləliklə, siz Pandemic 2 oyununda tədricən planetin bütün əhalisini məhv edəcəksiniz
