Ninja hər gün məşqə bir neçə saat ayırır və bu, formasını itirməmək və kritik anda üzünü itirməmək üçün lazımdır. Jungle Runner oyununun qəhrəmanı bacarıqlı və təcrübəli döyüşçüdür, lakin onun məşqi artıq onu qane etmir, ona çox asanlıqla gəlir, yəni inkişaf etmir. Buna görə də, qəhrəman cəngəlliyə getmək və ağacların arasından şaquli qaçmaq qərarına gəldi. Qəhrəman heyrətamiz sürətlə yuxarıya doğru tələsəcək və vəzifəniz onun heç bir şeylə və ya heç kimlə toqquşmadığından əmin olmaqdır. Belə çıxır ki, bizim ninja cəngəllikdə tək deyil, əlavə olaraq Jungle Runner-də mutant arılar onu dayandırmağa çalışacaqlar.