Zombi epidemiyası heç kəsi əsirgəmədi, ilk növbədə insanları vurdu, sonra heyvanları və quşları tutdu. Bəşəriyyət virusla mübarizə apardı və nəhayət bir müalicə tapıldı və işlər rəvan getdi. İnsanların sıralanması və heyvanlar aləminin növbəsi idi. Bütün zombi və hətta Flappy Zombirddəki kiçik quşumuz məhv edilməlidir. Ancaq yoluxub zombi quşuna çevrildiyi üçün heç ölmək də istəmir. Xilas olmaq üçün qəhrəman uçmaq və gizlənmək istəyir. Flappy Zombird yolunda bütün maneələri atlayaraq, havada özünü saxlamaq üçün quşa kömək et.