Ninja Assassin-də qəhrəman bir qatil Ninja və o, öz işini köməyinizlə edəcəyik. Hal-hazırda onun düşmənlərinə çevrilənlərin məhv edilməsindən ibarətdir. Əslində, vəzifə anbarlar təmizləməkdir. Onların üzərində geniş yayılmış hücum gözlənilir. Mühafizəçilər, fənərlərlə yollarını işıqlandıraraq qutuları olan otaqların ətrafında gəzirlər. Ninja fənərin yanında işıqlandırılmış zonada olarsa, gözətçi onu görəcək və ona hücum edəcəkdir. Qaranlıq tərəfdən seçilməli və dərhal hücum etməlisiniz. Bütün proses səssizdir ki, digər mühafizəçilər ninja qatillərindən ehtiyatlanmasınlar.
