Bir səhər Mario oyandı ki, arxası üstə uzanmağa nəsə mane oldu. Bəzi böyümələr taparaq, olduqca qorxdu və dərhal qorxudan özünə gəldi və baxmaq üçün güzgüyə qaçdı. Bunun arxasında nə göründü. Kiçik qanadları görən qəhrəman Flappy Mario-da heyrətə gəldi və hətta əvvəlcə üzüldü. Lakin sonra düşünərək qərara gəldi ki, uçmaq qabiliyyəti ona çoxlu üstünlüklər verəcək. O, artıq nəqliyyatla məşğul olmaq məcburiyyətində deyil, o, bir motosiklet və ya avtomobildən daha sürətli hava yolu ilə keçə bilər. Yalnız uçmağı öyrənmək qalır və siz Flappy Mario oyununa girərək ona bu işdə kömək edəcəksiniz.