Oyunun qəhrəmanı Ninja Assassin onun ninja Assassin adlandırılmasını tələb edir, baxmayaraq ki, zahiri görünüşü qəddar və amansız qatilə çox az bənzəyir. Bundan əlavə, oyun boyu heç kimə barmağı ilə toxunmaq fikrində deyil. Onun vəzifəsi bütün qızıl ulduzları keçmək və toplamaqdır. Oyuna daxil olsanız, ninjaya kömək edə bilərsiniz. Onu yol boyu istiqamətləndirin ki, o, daş yığınlarından, ayı üçün açıq şəkildə qurulmuş nəhəng tələlərdən və hər cür qəribə rəngarəng canlılardan qaçsın. Yuxarıdakı obyektlərlə həm canlı, həm də cansız toqquşma Ninja Assassin-də ninja kampaniyasının sona çatmasına səbəb olacaq.