Gone Rogue oyununda üç ninja döyüşçüsü iştirak edir. Şurikenləri məharətlə atan Qara Kuronun bunda tayı-bərabəri yoxdur. Qırmızı döyüşçü Aka qılınc tutmaqda o qədər mahirdir ki, hamı heyrətlənir. Bundan əlavə, Akinin qılıncı sehrli qabiliyyətlərə malikdir, ona zərər verərsə, düşməni ləngidə bilər. Yaşıl ninja Midori bir taktikdir. O, müxtəlif yerlərdə məharətlə tələlər qurur ki, düşmən onlara mütləq büdrəsin. Hər üç döyüşçü bir səbəbdən Gone Rogue-da göründü. Onlar İmperator tərəfindən göndərildi ki, qəhrəmanlar imperiyanın ən böyük kəndlərindən birini qarət edən yaramaz Uzuri ilə məşğul olsunlar. Gone Rogue-da bütün məhsulları toplamazdan əvvəl düşməni məhv etməlisiniz.
